Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF9P41273 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms