Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 TYE7YOR344C 876 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SHE4YOR035C 2370 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 APL3YBL037W 3078 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 UTP13YLR222C 2454 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YDL073WYDL073W 2955 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 DDR48YMR173W 1293 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SPR2YOR214C 711 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SUS1YBR111W-A 291 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YCL046WYCL046W 324 nt0.57□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 AIM9YER080W 1884 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 NUP157YER105C 4176 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RSM18YER050C 417 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SWT1YOR166C 1377 nt0.56□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RTT102YGR275W 474 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 ANS1YHR126C 480 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 CRG1YHR209W 876 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 TIM8YJR135W-A 264 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RCN1YKL159C 636 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SEC22YLR268W 645 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YLR366WYLR366W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SLS1YLR139C 1932 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SGD1YLR336C 2700 nt0.55□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 DPB11YJL090C 2295 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RIM20YOR275C 1986 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SRP14YDL092W 441 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 snR83snR83 306 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 NHP2YDL208W 471 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YDR115WYDR115W 318 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RPL29YFR032C-A 180 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 NUP82YJL061W 2142 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YJL086CYJL086C 369 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 PRP16YKR086W 3216 nt0.54□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 GDS1YOR355W 1569 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 TOF2YKR010C 2316 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YDR521WYDR521W 336 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 CYC7YEL039C 342 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RPL42BYHR141C 321 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RPL16AYIL133C 600 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 NBP1YLR457C 960 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RPL42AYNL162W 321 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 KAR3YPR141C 2190 nt0.53□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 SRB7YDR308C 423 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 IES5YER092W 378 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 VPS63YLR261C 327 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 CMC4YMR194C-B 222 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YBL062WYBL062W 381 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 TFB6YOR352W 1032 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 RKR1YMR247C 4689 nt0.52□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 PAU2YEL049W 363 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 GUP1YGL084C 1683 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 DFG10YIL049W 762 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 SMD3YLR147C 306 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 GIM5YML094W 492 nt0.51□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 IPI3YNL182C 1668 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YBR184WYBR184W 1572 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 SHE9YDR393W 1371 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 snR59snR59 78 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 GPM2YDL021W 936 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 HTB1YDR224C 396 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 PAU18YLL064C 363 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 PAU6YNR076W 363 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YBR012CYBR012C 420 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 MYO1YHR023W 5787 nt0.5□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 NUT1YGL151W 3399 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 REF2YDR195W 1602 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 CHZ1YER030W 462 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 SNO3YFL060C 669 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 LOC1YFR001W 615 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YGL109WYGL109W 324 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 ARV1YLR242C 966 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 SNO2YNL334C 669 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YPR172WYPR172W 603 nt0.49□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YCL020WYCL020W 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YDL068WYDL068W 330 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 TDA2YER071C 381 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 UTP10YJL109C 5310 nt0.48□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 MPT5YGL178W 2580 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 SMB1YER029C 591 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 YGR045CYGR045C 363 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 CUP1-1YHR053C 186 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 CUP1-2YHR055C 186 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.47□□□□□ -2.33
YHR140WP38842 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms