Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN2P35609 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms