Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXD13P35453 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms