Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD12P35452 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms