Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms