Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms