Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMLP26374 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMLP26374 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMLP26374 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMLP26374 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms