Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPREP23469 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPREP23469 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPREP23469 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPREP23469 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPREP23469 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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