Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms