Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2A2P16615 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms