Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSPP15924 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSPP15924 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DSPP15924 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DSPP15924 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSPP15924 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSPP15924 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSPP15924 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms