Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDPSP14324 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDPSP14324 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDPSP14324 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FDPSP14324 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FDPSP14324 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDPSP14324 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDPSP14324 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDPSP14324 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms