Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG2P13521 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG2P13521 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG2P13521 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG2P13521 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms