Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms