Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODC1P11926 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODC1P11926 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms