Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC192P0DO97 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms