Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CT47B1P0C2W7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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