Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRPRAP08240 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms