Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TYMSP04818 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TYMSP04818 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms