Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD4O95243 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD4O95243 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD4O95243 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD4O95243 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD4O95243 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD4O95243 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD4O95243 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms