Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB11FIP3O75154 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms