Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBNO60934 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBNO60934 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBNO60934 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBNO60934 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBNO60934 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms