Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX10O60683 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX10O60683 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX10O60683 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX10O60683 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PEX10O60683 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX10O60683 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX10O60683 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms