Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3O43889 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3O43889 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3O43889 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms