Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HTRA2O43464 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms