Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF3O43395 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms