Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms