Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms