Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKBO14920 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms