Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3QQQ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3QQQ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3QQQ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3QQQ9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3QQQ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3QQQ9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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J3QQQ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QQQ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QQQ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QQQ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3QQQ9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3QQQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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