Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BQV1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BQV1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BQV1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BQV1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BQV1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms