Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL13PA6NNM8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms