Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms