Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP16Q9Y5T5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP16Q9Y5T5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms