Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms