Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LEMD3Q9Y2U8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms