Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms