Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms