Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHF8Q9UPP1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms