Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms