Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PADI1Q9ULC6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms