Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCF2Q9UG63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms