Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXF1Q9UBU9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF1Q9UBU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms