Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DBF4Q9UBU7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DBF4Q9UBU7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms