Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms