Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CNTN3Q9P232 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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CNTN3Q9P232 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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CNTN3Q9P232 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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CNTN3Q9P232 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CNTN3Q9P232 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CNTN3Q9P232 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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CNTN3Q9P232 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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