Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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