Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms