Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms